Criadas a partir da Lei n° 6.792/16, que altera a LOB (Lei de Organização Básica da PMPI), as Diretorias constituem os órgãos de direção setorial para as atividades de pessoal, de administração financeira, de contabilidade, de logística e patrimônio, de ensino, instrução e pesquisa, de serviços de saúde, de telecomunicações e informática, de inteligência e de comunicação social, compreendendo:
I - Diretoria de Gestão de Pessoas (DGP);
II - Diretoria de Administração e Finanças (DAF);
III - Diretoria de Ensino, Instrução e Pesquisa (DEIP);
IV - Diretoria de Telemática (DITEL);
V - Diretoria de Saúde (DS);
VI - Diretoria de Inteligência (DINT);
VII - Diretoria de Comunicação Social (DCOM).